总体而言，像“针式PKM”等单机版工具侧重个人知识库的建立，重视个人知识管理实施中的第一步即知识的积累、查询，对于知识的表达也即显性知识和隐性知识的转化、知识的共享、协作学习方面功能缺乏支持。而基于 WEB的个人知识管理系统易于访问，可以随时随地访问自己的知识库，与他人进行交流共享，进行协作学习的支持较好，但由于网络传输速度的限制，对于个人进行知识库的累积支持不够。而使用服务器和客户端模式的个人知识管理系统，使用也不够方面，不能与别的软件兼容。未来的知识管理是移动化的趋势，个人可以通过 PDA无线工具上网随时访问自己的知识库，进行个人知识管理。
个人选择知识管理工具时，必须注意到以下三个问题：
(1) 世界上没有任何两个人具有完全相同的学习习惯，人们的智力能力也千差万别。而且，任何一种所谓成功的学习方法如果不加变通地运用，则会出现对一个人是妙方，对另外的人变成毒药的情况。因此，个人知识管理选型务必要根据自身知识结构和学习方法，不断在实践中构建一套适用于自身需求的个人知识管理工具。针式PKM是以开发团队多年的实践经验为基础进行设计开发的，可以避免多数人再走个人知识管理模索的弯路。
(2) 由于个人知识构成复杂，仅从内容上看就包括：构思、灵感、通讯、书信、电子邮件、传真、待办事宜、财务信息、网站链接等类型，从形式上看又包括结构化和非结构化的内容，因此不存在可以全面解决PKM问题的个人知识管理工具。
(3) 任何知识管理系统或知识管理平台都能起到文档记录的作用，要发挥知识的作用，最终还得靠发挥个人的作用。只有关心个人的知识管理，才能在知识运用上找到更多的机会，更大程度地发挥出个人的价值。
从个人知识管理软件工具操作的学习来说，应用是最好的学习方式，而不是把工具当着学习对象，专门刻意地进行解读研究来学习。对具体工具的比较全面的了解，会随着应用的推进而渐进深入。比如对于搜索引擎的使用，就初学者而言，最简单使用就是学会输入关键词，去查询自己想要进一步了解的内容即可。初学者对工具操作的学习，不宜一开始就花很多时间进行全面地解读，对一个领域相关知识没有达到相对通达的情况下，就从某个点钻下去，收获的更多是困惑或者说是徒劳。
因此，对于技术工具操作的学习，不宜复杂化其学习过程，这也是符合简单原则，以满足最简单、最初级学习需求为宜。学习者在应用的过程中，会不断生成新的学习能力，从而可能达到对工具的进一步熟练或精深层次的掌握。当然，掌握针式PKM等软件工具的操作之后的灵活应用，也是不同学习者个人智慧的发挥和积累的体现